Институт основан в 1960 году и входил в систему Минэнерго СССР в качестве регионального центра на востоке страны и являлся головным республиканским институтом по проектированию систем централизованного теплоснабжения на базе ТЭЦ с комбинированным производством электрической и тепловой энергии, а также схем теплоснабжения промышленных городов и предприятий.
С момента образования Институт именовался Алма-Атинским отделением Государственного союзного проектного института «Промэнергопроект», а в 1974 году был переименован в Среднеазиатское отделение Всесоюзного государственного научно-исследовательского и проектно-конструкторского института по промышленной энергетике и рациональному использованию в промышленности топлива, электрической и тепловой энергии (САО «ВНИПИЭнергопром»).
За годы деятельности институт САО «ВНИПИЭнергопром» приобрёл статус крупной проектной организации, ответственной за формирование технической политики в области централизованного теплоснабжения в Казахстане и республиках Средней Азии, а также в ряде городов Российской Федерации и за рубежом.
Этот этап деятельности института характеризовался разработкой и внедрением в проекты более совершенных и прогрессивных технических решений, обеспечивающих повышенную производительность и экономичность сооружаемых ТЭЦ. Были начаты работы по коренной перестройке типового проектирования, а также научно-исследовательские работы по промышленной энергетике и рациональному использованию энергоресурсов.
В 1992 году Среднеазиатское отделение «ВНИПИЭнергопром» было преобразовано в самостоятельное государственное предприятие Институт «КазНИПИЭнергопром», находящиеся под прямым управлением Министерства энергетики и угольной промышленности Республики Казахстан.
С 1998 года Институт «КазНИПИЭнергопром» является частным предприятием.
В настоящее время АО «Институт «КазНИПИЭнергопром» продолжает традиции по комплексному проектированию тепловых электростанций и систем централизованного теплоснабжения.
За всю свою деятельность начиная с 1960 года Институт достиг высокого уровня по проектированию теплоэлектроцентралей, крупных котельных и объектов тепловых сетей и является ведущей организацией в области проектирования централизованного теплоснабжения в Республике Казахстан.
По проектам института «с нуля» построены многие теплоэнергетические объекты.
Институт участвует в разработках Стратегии развития электроэнергетики и топливно-энергетических балансов РК на перспективу и является автором Схем теплоснабжения промышленных центров и крупных городов РК.
Сфера деятельности института постоянно расширяется.
Институт укомплектован высококвалифицированными специалистами (теплоэнергетиками, электриками, строителями, гидротехниками и др.) с многолетним стажем работы в энергетике и комплексном проектировании тепловых электрических станций и тепловых сетей, использующие опыт предыдущих поколений проектировщиков, обеспечивших становление института.
В последние годы коллектив института пополняется молодыми специалистами, которые перенимают опыт старших наставников, продолжают и приумножают лучшие традиции комплексного проектирования тепловых электрических станций и тепловых сетей.
В настоящее время Институт оснащен современной многофункциональной и постоянно обновляемой компьютерной, графопостроительной и множительной техникой.
Технический уровень, качество выпускаемых работ отвечают международным стандартам.
С 2004 года в институте действует система менеджмента качества применительно к проектной деятельности, изыскательской деятельности и инжиниринговым услугам в сфере архитектуры, градостроительства и строительства в соответствии с требованиями национального стандарта СТ РК ИСО 9001-2009.
С 2013 года применительно к проектной деятельности, изыскательской деятельности и инжиниринговым услугам в сфере архитектуры, градостроительства и строительства в соответствии с национальными стандартами СТ РК ИСО 14001-2006 и СТ РК ОНSАS 18001-2008 АО «Институт«КазНИПИЭнергопром» были выданы сертификаты соответствия систем экологического менеджмента и менеджмента профессиональной безопасности и здоровья.
АО «Институт «КазНИПИЭнергопром» располагает информационно-технической базой, содержащей многочисленные материалы технического архива проектов, рабочей и сметной документации, научно-технической библиотеки и группы промышленного технологического оборудования.
Институт является одним из учредителей Казахстанской Электроэнергетической Ассоциации, принимает активное участие в ее работе — прежде всего в пропаганде и внедрении в энергетику новых технологий, направленных на повышение энергоэффективности и энергосбережения.